Puchar Ekstraklasy to były coroczne rozgrywki dodatkowe wyłącznie dla klubów Ekstraklasy.
Zawody miały być uzupełnieniem sezonu, chodziło o to, aby zwiększyć piłkarzom liczbę rozegranych meczów. Drużyny najpierw rywalizowały w grupach, potem w fazie play-off.
Niestety, niemal od początku rozgrywki były traktowane nieco po macoszemu przez wszystkich: same kluby, ale też kibiców. Mecze rozgrywano w środku tygodnia, na dodatek triumf w rozgrywkach nie dawał przepustki do europejskich pucharów. Trenerzy zazwyczaj decydowali się na grę zawodnikami rezerwowymi, zresztą, formuła turnieju dopuszczała wystawianie zawodników nie zgłoszonych do rozgrywek Ekstraklasy.
W końcu spadło także zainteresowanie stacji telewizyjnych. Puchar Ekstraklasy od początku transmitowany był przez kanały Grupy Polsat, która jednak po trzech latach zdecydowała się wycofać z nieopłacalnego interesu. Ostatecznie rozegrano zaledwie trzy edycji PE.
Zwycięzcy Pucharu Ekstraklasy
2007 - Groclin Dyskobolia Grodzisk Wlkp.
2008 - Groclin Dyskobolia Grodzisk Wlkp.
2009 - Śląsk Wrocław